En el marco de la pasada VI Conferencia BCN-Pittsburg el Dr. Agustín Ruiz de la empresa NEOCODEX (compañía sevillana de biotecnología) ofreció un vistazo sobre el estado de una investigación genética que fue presentada precisamente en 2006 en la V edición de la mencionada Conferencia.

La variabilidad genómica es un elemento clave del riesgo diferencial entre individuos. En este marco, la importancia del estudio de NEOCODEX es incuestionable si se tiene en cuenta que la mayoría de los casos de EA son y serán esporádicos (no hereditarios), debido a las tasas de natalidad de los países occidentales.

Esta situación será consecuencia de que, en la sociedad actual, la tendencia es a tener un hijo por generación. Es decir, en una familia numerosa de 15 o 20 hijos, si alguno de los padres tiene una mutación genética (de las conocidas que causan EA) esto indica que el 50% de los hijos tendrían EA. Sin embargo, si se tiene solo un hijo, como es lo común actualmente ¿Qué riesgo tiene este individuo? Ese es el interés por este estudio, un interés muy universal.

Esta es la premisa que alimenta la que hoy es investigación genética en desórdenes neurodegenerativos comunes, que se lleva a cabo mediante disección multifocal. El estudio, en pleno desarrollo, pretende detectar combinaciones de distintos marcadores dispersos en el genoma y que confieren un mayor riesgo de padecer enfermedades como el Parkinson (PK) y Alzheimer (EA).

Según el Dr. Ruiz « el gran reto de la investigación genómica ahora mismo es saltar de las formas hereditarias a las formas no hereditarias de todas las enfermedades comunes. Este tipo de abordajes no solo se están empleando en Alzheimer, sino en varios tipos de cáncer, enfermedades cardiovasculares y en general en todas las que llamamos enfermedades comunes». 

En el marco de esta investigación se han estado haciendo estudios de caso-control con más de 250.000 marcadores genéticos, a lo largo de todo el genoma de los individuos para tratar de encontrar combinaciones genéticas que expliquen el riesgo o el por qué un individuo sin antecedentes de EA sufre la enfermedad. Y ese es el reto del proyecto que se tiene en ciernes.

En resumen, la investigación procura identificar los factores genéticos no mendelianos, es decir que no se transmiten de generación de generación en una familia, y que pueden estar influyendo sobre el riesgo individual de padecer la enfermedad. Así pues los resultados de la investigación darán una respuesta individual a una franja de población amplísima, y lo que va es a serenar y a colocar cada cosa en su sitio.

El método de estudio

La investigación se lleva a cabo mediante la introducción de los datos genómicos de individuos que tienen PK o EA pero que no tienen antecedentes de ningún tipo de PK o EA en la familia, y compararlos con individuos del mismo sexo y la misma edad que no tienen estas enfermedades. Lo que se sospecha es que estos individuos tienen una serie de combinaciones -no es un gen que se hereda de los padres- de distintos marcadores dispersos en el genoma que confieren un mayor riesgo de padecerlos. Lo que se detectará son esos patrones, denominados técnicamente "patrones de interacción génica" pero que todavía son desconocidos.

El problema es que en el PK y la EA (y en otras enfermedades neurodegenerativas) se sospecha que existen estos patrones, que son comunes en la población, porque la incidencia de las enfermedades es muy grande. Por ejemplo, en España existen casi medio millón de personas afectadas por la EA, pero lo que no sabemos es el número de factores involucrados y cómo se combinan entre ellos para producir riesgo. Por eso vale la pena recalcar que el objetivo del proyecto es identificar esos factores genéticos o combinaciones de ellos como patrones y factores de riesgo que confieren una alta probabilidad de que un individuo sin antecedentes sufra la enfermedad.

Para ello, es necesario crear, mantener y utilizar bases de datos genéticas que contengan toda la información, para así analizarla y detectar las correlaciones existentes entre la información del ADN y la aparición de una enfermedad. Es importante anotar que para este tipo de estudio se necesitan bancos de ADN muy bien clasificados, además de una tecnología muy sofisticada tal como de la que dispone NEOCODEX.

De hecho, para el desarrollo de la investigación esta empresa se ha servido de una serie de bancos de datos rastreo completo del genoma que han puesto a disposición de la comunidad científica varios grupos de investigación de todo el mundo. Concretamente, el estudio lleva involucrados tal cantidad de estudios sobre marcadores genéticos que «seguramente es uno de los estudios de investigación epidemiológica más grande que se han hecho en Europa», según el Dr. Ruiz. La misma NEOCODEX  utiliza su propio biobanco de ADN (al cual contribuye Fundació ACE aportando su banco de muestras de ADN).

Así pues, gracias al acceso de NEOCODEX a los datos genómicos de rastreo completo del genoma (provenientes de los diversos bancos, entre ellos de la NHIS de los Estados Unidos), en este momento ya se ha hecho un rastreo completo del genoma en Parkinson y 1440 casos genómicos de EA.

Por medio del método HDDC (para análisis multivariantes) se ha llevado a cabo un análisis que ha dado como resultado la identificación de 300 marcadores genéticos, es decir parejas o tríadas de genes relacionados con PK y EA (en un grupo de 270 casos y 270 controles). El paso siguiente es confirmar y validar tales marcadores de modo que ofrezcan una posibilidad de diagnóstico lo más universal posible, es decir que se repliquen, de cara a un potencial desarrollo de métodos de diagnóstico molecular, y al desarrollo de marcadores que den respuesta a las diferentes pautas terapéuticas.                                                                                

Algunas de las conclusiones preliminares del estudio presentadas por el Dr. Ruiz  señalan que es factible un estudio exhaustivo de asociación digénica (dos genes) de todo el genoma; que la patogénesis (características de la enfermedad) del Parkinson y la EA podría compartir algunos elementos genéticos que han sido sistemáticamente explorados. Con miras a la continuación del estudio, señaló que es necesaria una replica independiente en series españolas (entre las que se cuentan las aportadas por Fundació ACE) de Parkinson y EA, para su validación.

El Dr. Agustín Ruiz es Genestista. Director I + D. NEOCODEX, Sevilla.